二类经济适用房和商品房在房屋性质、交易费用和优惠政策等方面存在很明显的区别。

　　二类经济适用房是专门为低收入者建造的房屋，由国家安排建造，一般都会采用行政划拨的方式，具有一定的保障性质。而商品房则是由开发商自行建造，面向所有群体出售，不具备保障性质。

　　二类经济适用房交易时需按照房屋成交价格的3%缴纳土地出让金，但商品房正常出售即可，不需要交土地出让金。

　　二类经济适用房能够轻松的享受到我国的很多政策，如购房补贴、贷款优惠等；而商品房基本没什么优惠政策可以享受。

　　一类经济适用房是面向社会公开发售的经济适用房，由城市政府组织房地产开发企业或集资建房单位建造，以微利价向城镇中低收入家庭出售的住房。而二类经济适用房一般是回迁性质或康居、安居性质的房屋。

　　一类经济适用房的房本是两限房房本，必须满5年后才可以上市出售，且上市前，先由政府决定是不是优先回购，政府决定不回购方可出售。而二类经济适用房上市交易不受是否满五年限制，只要取得产权证就可以上市交易。

　　二类经济适用房和商品房在房屋性质、交易费用和优惠政策等方面存在很明显的区别。同时，一类经济适用房和二类经济适用房在房屋性质和交易限制等方面也不一样。购房者在选择时应依据自己需求和经济情况进行合理选择。